مجلس الإدارة هو السلطة التشريعية و التنفيذية للمسجد و المأتمين , يقوم بتنفيذ بنود النظام الأساسي ويعمل وفقا لتوجيهات و توصيات الجمعية العمومية لتحقيق اهداف المسجد و المأتمين ويتكون مجلس الإدارة من 9 أعضاء, يتم انتخابهم من قبل الجمعية العمومية عن طريق الاقتراع السري المباشر